Игорь, здравствуйте.
Для продления срока временного пребывания необходимо было представить в миграционные органы (п. 2 ст. 5 ФЗ «О правовом положении иностранных граждан»):
ходатайство образовательной организации, в которой иностранный гражданин обучается по очной или очно-заочной форме по основной профессиональной образовательной программе, имеющей государственную аккредитацию, о продлении срока временного пребывания в Российской Федерации такого иностранного гражданина
либо подать документы на получение разрешения на временное проживание, либо получить патент на работу.
Учитывая, что регистрация заканчивается 31.07.2016, а необходимые документы представлены не были, регистрация вряд ли будет продлена. Т.е. необходимо выехать на 3 месяца.