На кого подавать в суд, если дачный домик пришел в негодность?

По общему правилу

Вред, причиненный личности или имуществу гражданина, а также вред, причиненный имуществу юридического лица, подлежит возмещению в полном объеме лицом, причинившим вред.

Из Вашего вопроса в итоге неясно, по чьей вине был причинен вред. Это обстоятельство нужно установить для определения лица, к которому можно будет предъявить иск. Если данное подтопление произошло по вине товарищества, то требования можно предъявить к Товариществу (а не к председателю).

В Вашей ситуации есть и другие сложности. Вы указали, что «дачный участок, еще не приватизирован». При этом из вопроса неясно, имеются ли у Вас оформленные в надлежащем виде права пользования данным участком вообще? Предполагаю, что указанный Вами домик тоже никак не был оформлен и если так, то Вам надо будет доказать суду факт его существования в том или ином виде (юридически это тогда домом не является, а будет восприниматься судом как набор «лесопиломатериалов» или в лучшем случае как объект незавершенного строительства); а также размер причиненного Вам ущерба. Если же домик все-таки оформлен, то часть указанных выше обстоятельств доказывать не придется, кроме оценки размера причиненного ущерба.