Какое наказание грозит заказчику в случае несвоевременной обработки протокола разногласий?

Добрый день, Катерина!

В действующем законодательстве нет наказаний за несвоевременную обработку протокола разногласий. 

С уважением,

Катерина, добрый день. Если протокол разногласий не согласован между сторонами, то договор в таком случае считается не заключённым. Ст. 432 ГК РФ:

1. Договор считается заключенным, если между сторонами, в требуемой в подлежащих случаях форме, достигнуто соглашение по всем существенным условиям договора.
Существенными являются условия о предмете договора, условия, которые названы в законе или иных правовых актах как существенные или необходимые для договоров данного вида, а также все те условия, относительно которых по заявлению одной из сторон должно быть достигнуто соглашение.

Катерина, любой договор считается заключенным, когда сторонами достигнуто соглашение по всем существенным условиям договора. К таким условиям относятся те условия, которые признаются существенными законом (обязательно предмет договора, а также иные условия, обязательные по закону (в зависимости от вида договора)) либо договором (те условия, которые названы в качестве существенных в самом договоре).  Никакой ответственности законом за нерассмотрение/несвоевременное рассмотрение протокола разногласий не установлено, однако такая ответственность может быть предусмотрена в самом договоре. При этом такая договорная ответственность может наступить только в случае, когда сторонами согласованы все существенные условия (следовательно, договор считается заключенным).