Юлия, здравствуйте!
Согласно гражданско-процессуальному законодательству, иски о лишении родительских прав предъявляются по месту жительства ответчика (ст.28 ГПК РФ). Если место жительства ответчика неизвестно или в Российской Федерации его место жительства отсутствует, то иск о лишении родительских прав может быть предъявлен в суд по месту нахождения его имущества или по его последнему известному месту жительства в Российской Федерации (п.1 ст.29 ГПК РФ).
По моему мнению оспаривать решение судьи не стоит, так как Ваши иски не полностью отвечают условиям принятия «встречного» иска.
«Гражданский процессуальный кодекс Российской Федерации» от 14.11.2002 N 138-ФЗ (ред. от 29.07.2017) (с изм. и доп., вступ. в силу с 10.08.2017)
Статья 138. Условия принятия встречного иска
Судья принимает встречный иск в случае, если:
встречное требование направлено к зачету первоначального требования;
удовлетворение встречного иска исключает полностью или в части удовлетворение первоначального иска;
между встречным и первоначальным исками имеется взаимная связь и их совместное рассмотрение приведет к более быстрому и правильному рассмотрению споров.
В Вашем деле «зачета» не усматривается. Кроме того — если отец не «отец», и Вы оспариваете его отцовство — для чего лишение родительских прав?
Юлия, если у вас остались вопросы, можете написать мне в чате и заказать персональную консультацию или подготовку документа по вашему вопросу. Всего доброго!