Здравствуйте, Игорь!
Вы можете использовать для уплаты налога одновременно два вычета:
1. В размере 1 млн. рублей — позволяет в целях исчисления налога уменьшить доход. Например, квартиру продали за 3 млн. рублей, за счет вычета налогооблагаемый доход составит 2 млн. рублей
Статья 220. Имущественные налоговые вычеты
2. Имущественный налоговый вычет, предусмотренный подпунктом 1 пункта 1 настоящей статьи, предоставляется с учетом следующих особенностей:
1) имущественный налоговый вычет предоставляется:
в размере доходов, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков или доли (долей) в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее минимального предельного срока владения объектом недвижимого имущества, установленного в соответствии со статьей 217.1 настоящего Кодекса, не превышающем в целом 1 000 000 рублей;
2. Имущественный налоговый вычет в размере произведенных расходов на покупку новой квартиры, но не более 2 млн. рублей
3. Имущественный налоговый вычет, предусмотренный подпунктом 3 пункта 1 настоящей статьи, предоставляется с учетом следующих особенностей:
1) имущественный налоговый вычет предоставляется в размере фактически произведенных налогоплательщиком расходов на новое строительство либо приобретение на территории Российской Федерации одного или нескольких объектов имущества, указанного в подпункте 3 пункта 1 настоящей статьи, не превышающем 2 000 000 рублей.
3. Вычет, указанный в п.2, может быть зачтен в целях уплаты налога от продажи старой квартиры, если обе сделки произошли в одном году.
с чего вдруг не возникает налогового обязательства? Вы вопрос то внимательно читали?
Собственно поскольку квартиры Вы уже продали и купили, каких то иных вариантов кроме как уменьшить налогооблагаемую базу от продажи на сумму двух вычетов нет. Первый вычет дается ежегодно но не более 1 млн. Второй дается один раз в жизни.