Дмитрий,
поскольку квартира была приобретена в браке, вы не сможете продать ее без нотариально удостоверенного согласия бывшей супруги (п.3 ст.35 СК РФ), поэтому вам уже сейчас нужно обращаться в суд с иском о разделе совместно нажитого имущества. Выплата отступного не решит проблему, поскольку квартира не изменит свой имущественный режим и продолжит являться вашим совместным имуществом.
Доли супругов в праве собственности на имущество признаются равными, и в вашем случае оснований для раздела квартиры в иных долях не усматривается (п.1 ст.39 СК РФ). Долги делятся пропорционально присужденным долям в праве собственности на имущество (п.3 ст.39 СК РФ), поэтому при разделе квартиры в равных долях вы имеете право взыскать с бывшей супруги половину того, что уже было уплачено вами по кредитному договору, а также разделить обязательство по уплате будущих периодических платежей по кредитному договору до полного погашения кредита (правда обязательство по уплате 1/2 кредита возникнет у вашей бывшей супруги не перед банком, а перед вами, то есть должником по кредитному договору по прежнему останетесь вы).
Если в процессе судебного разбирательства вы придете к взаимному согласию о разделе имущества на определенных условиях (выплата отступного, доля в праве на имущество и т.д.), вы сможете заключить мировое соглашение в судебном заседании. Соглашение, утвержденное судом, имеет силу судебного решения, и будет являться основанием для государственной регистрации продажи квартиры на условиях этого соглашения.