Дарья, здравствуйте!
Если у директора ЭЦП на юридическое лицо с идентификацией, что это директор, то да лично или через представителя или через нотариуса.
Если же имеется ЭЦП на физическое лицо, то можно, при наличии доверенности, попробовать подать документы. Фактически эцп подтверждает, что документ подписало конкретное лицо.
Видами электронных подписей, отношения в области использования которых регулируются настоящим Федеральным законом, являются простая электронная подпись и усиленная электронная подпись. Различаются усиленная неквалифицированная электронная подпись (далее — неквалифицированная электронная подпись) и усиленная квалифицированная электронная подпись (далее — квалифицированная электронная подпись). (ст. 5 Федеральный закон «Об электронной подписи» от 06.04.2011 N 63-ФЗ)
Информация в электронной форме, подписанная квалифицированной электронной подписью, признается электронным документом, равнозначным документу на бумажном носителе, подписанному собственноручной подписью, и может применяться в любых правоотношениях в соответствии с законодательством Российской Федерации, кроме случая, если федеральными законами или принимаемыми в соответствии с ними нормативными правовыми актами установлено требование о необходимости составления документа исключительно на бумажном носителе. (ч.1 ст. 6 Указанного закона)