Могу ли я отдавать приказы своему командиру роты?

Здравствуйте Александр!

В вашем случае первостепенную роль играет должность (хотя бы и временное исполнение обязанностей по должности), а не звание.

Устав внутренней службы Вооруженных Сил Российской Федерации

34. По своему служебному положению и воинскому званию одни военнослужащие по отношению к другим могут быть начальниками или подчиненными.

35. Начальники, которым военнослужащие подчинены по службе, хотя бы и временно, являются прямыми начальниками.