Василий!
Проблема в данном случае состоит в том, что до настоящего времени не существует отдельного нормативно-правового акта, который регламентирует деятельность гаражно-строительных кооперативов, но к их деятельности в полной мере применимы общие нормы гражданского законодательства.
Поскольку Вы являетесь собственником объекта недвижимости, которым, безусловно, является бокс в гаражно-строительном кооперативе, а бокс, как объект недвижимости, безусловно включает в себя все составляющие части объекта недвижимого имущества, в том числе и крышу (без неё же гараж как таковой невозможно представить), следует признать, что Вы как собственник объекта недвижимости, имеете полное право на защиту своей собственности согласно положениям Гражданского Кодекса РФ:
Статья 304. Защита прав собственника от нарушений, не связанных с лишением владения
Собственник может требовать устранения всяких нарушений его права, хотя бы эти нарушения и не были соединены с лишением владения.
Вы вправе требовать от любого лица устранения любых препятствий для надлежащей эксплуатации своего гаража, в том числе и связанных с возможным повреждением перекрытия гаража.
Возможна ситуация, когда органы кооператива (собрание, правление) в установленном порядке приняли какие-то решения относительно возможности использования площадки над гаражами в интересах кооператива или третьих лиц. Тогда надо внимательно ознакомиться с такими решениями и оценить возможность их оспаривания как нарушающих Ваши права либо потребовать принятия мер для устранения допускаемых нарушений в рамках деятельности кооператива по использованию площадок над гаражами (если такая деятельность ведётся).
Если же никаких решений никем не принималось, Вы имеете полное право самостоятельно принять меры для защиты своей собственности, не ущемляя интересов других лиц, но эти интересы должны быть основаны на законе либо распорядительных решениях кооператива.
Если о таких решениях Вам ничего не известно и их не было — смело ставьте ограждение на крышу.
Имейте также в виду, что в соответствии с положениями того же Гражданского Кодекса РФ:
Статья 1064. Общие основания ответственности за причинение вреда
1. Вред, причиненный личности или имуществу гражданина, а также вред, причиненный имуществу юридического лица, подлежит возмещению в полном объеме лицом, причинившим вред.
Так что лицо, регулярно повреждающее крышу Вашего гаража, должно понимать, что в конечном итоге Вы можете потребовать возмещения причинённого Вам ущерба (стоимость ремонта крыши и возможного повреждения иного имущества).