Здравствуйте! В данном случае Вы можете воспользоваться налоговым вычетом в размере 1000000 рублей. В соответствии с пунктом 2 статьи 220 Налогового кодекса
Имущественный налоговый вычет предоставляется с учетом следующих особенностей:
1) имущественный налоговый вычет предоставляется:
в размере доходов, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи… квартир..., находившихся в собственности налогоплательщика менее минимального предельного срока владения объектом недвижимого имущества, установленного в соответствии со статьей 217.1 Налогового кодекса РФ, не превышающем в целом 1 000 000 рублей..."
И соответственно, налог на доходы физических лиц не оплачивается.