Здравствуйте!
До создания в 1998 году (в некоторых субъектах РФ — в 2000 году) органов по регистрации недвижимости их функции выполняли органы БТИ. В соответствии с Инструкцией «О порядке регистрации строений в городах, рабочих, дачных и курортных поселках РСФСР», утв. приказом Минкомхоза РСФСР от 21.02.1968 органы БТИ проставляли на правоустанавливающем документе т.н. «регистрационную надпись», вносили сведения о регистрации в реестровую книгу города (поселка).
При отсутствии факта регистрации договора приватизации в БТИ право собственности на квартиру не будет признано ранее возникшим.
В случае если Вам сейчас откажут в регистрации (а скорее всего будет именно так) Вам необходимо будет обратиться в суд для признания права собственности на квартиру в порядке приватизации.