Отказывают в прописке гражданской жены с ребенком из-за нехватки квадратных метров

Здравствуйте Руслан.

 Действительно законодательством предусмотрено право на отказ наймодателя.в Вашем случае муниципальной администрации на вселение при наличии определенных законом оснований.

Т.е. муниципалитет здесь является собственником и в соответствии со 

ЖК РФ Статья 70. Право нанимателя на вселение в занимаемое им жилое помещение по договору социального найма других граждан в качестве членов своей семьи
 

Наймодатель может запретить вселение граждан в качестве проживающих совместно с нанимателем членов его семьи в случае, если после их вселения общая площадь соответствующего жилого помещения на одного члена семьи составит менее учетной нормы.