Можно ли получить выписку о нахождении в море, чтобы вступить позже в наследство?

Выписку взять возможно, но использовать ее нужно будет при подаче наследственного иска за пределами шестимесячного срока. Такой иск подаётся в суд общей юрисдикции по месту открытия наследства. Судебная практика обширна и серьезных препятствий к решению проблемы нет. 

Дополнительно уточните — нет ли в доступности человека, имеющего доверенность от моряка — тогда этот человек может обратиться к нотариусу.

Кроме того, капитан корабля вправе удостоверить доверенность на представление интересов моряка любым лицом. Можно передать по каналу связи данные потенциального представителя, а готовую доверенность выслать почтой из ближайшего порта, в котором причалит корабль.