Здравствуйте Александр.
С точки зрения жилищного законодательства градостроительное зонирование территории муниципального образование (отнесение к земле СХН -1) не имеет никакого значения к отношением по изменению назначения помещения с нежилого в жилой. Все основания для отказа указаны в ч. 1 ст. 24 ЖК РФ и того, как отнесение здания к определенной территориальной зоне там нет.
Тем более учитывая положения ч. 8 ст. 36 ГрК РФ
Земельные участки или объекты капитального строительства, виды разрешенного использования, предельные (минимальные и (или) максимальные) размеры и предельные параметры которых не соответствуют градостроительному регламенту, могут использоваться без установления срока приведения их в соответствие с градостроительным регламентом, за исключением случаев, если использование таких земельных участков и объектов капитального строительства опасно для жизни или здоровья человека, для окружающей среды, объектов культурного наследия.
Т.е. единственным оправданием перевода могло служить только выделенное жирным выше. В вашем же случае перевод их нежилого в жилое явно не опасно для жизни и здоровья и для окружающей среды.
Поэтому считаю, на этом основании можно оспорить отказ в суде в порядке КАС РФ.
Либо начните с жалобы в прокуратуру. Иногда помогает.
Желательно посмотреть на эти документы.
Пока могу ответить только следующее:
Возможно, одна из причин отказа указана в ч. 4 ст. 22 ЖК РФ. Поэтому нужно смотреть решение об отказе.