Добрый день.
Полагаю, отказ в совершении регистрационных действий незаконен, поскольку в силу п. 14.4 ст. 1 Градостроительного кодекса РФ снос объекта капитального строительства определен как ликвидация объекта капитального строительства путем его разрушения (за исключением разрушения вследствие природных явлений либо противоправных действий третьих лиц), разборки и (или) демонтажа объекта капитального строительства, в том числе его частей.
То есть в Вашем случае будет иметь место не снос, а гибель (уничтожение) объекта.
Согласно ч. 1 ст. 23 Федерального закона от 13.07.2015 N 218-ФЗ «О государственной регистрации недвижимости», акт обследования представляет собой документ, в котором кадастровый инженер в результате осмотра места нахождения здания, сооружения, помещения, машино-места или объекта незавершенного строительства с учетом имеющихся сведений Единого государственного реестра недвижимости о таком объекте недвижимости, а также иных предусмотренных требованиями к подготовке акта обследования документов подтверждает прекращение существования здания, сооружения или объекта незавершенного строительства в связи с гибелью или уничтожением такого объекта недвижимости либо прекращение существования помещения, машино-места в связи с гибелью или уничтожением здания или сооружения, в которых они были расположены, гибелью или уничтожением части здания или сооружения, в пределах которой такое помещение или такое машино-место было расположено.
В этой связи в силу п. 7 ч. 2 ст. 14, ч. 1 ст. 23 Федерального закона от 13.07.2015 N 218-ФЗ «О государственной регистрации недвижимости»отказ в регистрации неправомерен, акт обследования является достаточным основанием для совершения регистрационных действий.
С высокой долей вероятности (на основании изложенного в вопросе) имеются основания для признания такого отказа незаконным в судебном порядке.
Однако хотелось бы все таки видеть текст письма об отказе, чтобы составить полную картину и понять логику регистрирующего органа.
С уважением,