Марина, добрый день.
Подать заявление Вы действительно можете дистанционно, через сайт Госуслуги. Но к сожалению для оформления регистрации Вам и собственнику помещения необходимо будет присутствовать лично в отделении ФМС.
Регистрация гражданина по доверенности прямо не запрещена и прямо не разрешена действующим законодательством, однако в некоторых отделениях идут на уступки и разрешают регистрацию по доверенности.
Для этого Вам желательно проконсультироваться в отделении ФМС по желаемому месту регистрации.
______________
С Уважением, юрист Алина Рыкова.