Добрый день!
Если я правильно понял, у Вас будет такая схема.
Вы-ИП Арендодатель сдаете в аренду дом, некоему лицу — Арендатору, а он в свою очередь, сдает его в субаренду?
В этом случае Вы будете платить налог(размер зависит от системыобложения, которую Вы выбрали) с полученных доходов (арендная плата). И все. Независимо от того, кто является Вашим арендатором (ИП или физ.лицо). Они сами будут разбираться со своими налогами, Вас это ни как не коснется.
Но если арендатор будет работать по Вашему ИП, тогда Договора аренды с теми, кому будет сдаваться дом, будут заключаться от Вашего ИП. Налог вам придется платить именно с суммы указанной в договоре. Естественно он будет больше, чем в первом случае. Так как арендная плата этим лицам будет больше. Как Вы потом будете разбираться по этим налогам с Арендатором (он должен будет Вам вернуть свою часть налогов)