При обращении в банк увидел что долг на момент увольнения составит 1200000 практически большая часть стоимости квартиры

Олег, добрый день! В соответствии с Федеральным законом от 20.08.2004 N 117-ФЗ  «О накопительно-ипотечной системе жилищного обеспечения военнослужащих» вы являлись участником жилищно-накопительной системы.

Об этом Вас должен был уведомить руководство Воинской части, где вы проходите военную службу в письменной форме. (ч. 5 ст. 9 Закона о накопительно-ипотечной системе)

Согласно статье 10 Данного федерального закона:

Основанием возникновения права на использование накоплений, учтенных на именном накопительном счете участника, в соответствии с настоящим Федеральным законом является:
1) общая продолжительность военной службы, в том числе в льготном исчислении, двадцать лет и более;

2) увольнение военнослужащего, общая продолжительность военной службы которого составляет десять лет и более: 

1.  по достижении предельного возраста пребывания на военной службе;
2.  по состоянию здоровья — в связи с признанием его военно-врачебной комиссией ограниченно годным к военной службе;
3.  в связи с организационно-штатными мероприятиями;
4.  по семейным обстоятельствам, предусмотренным законодательством Российской Федерации о воинской обязанности и военной службе;

В соответствии со ст. 11 Закона Вы имеете право использовать данные денежные средства целях приобретения жилого помещения или жилых помещений в собственность или в иных целях после возникновения права на использование этих средств.

В данном случае обратитесь к руководству Воинской части с заявлением о распоряжении денежных средств, находящихся на Вашем накопительном счете для погашения оставшихся оставшейся суммы.

Обязанность исполнения денежного обязательства перед Банком (или перед Воинской частью- если вы оформили целевой жилищный заем) возлагается на Вас, независимо от того, уволитесь Вы или нет. Квартиру при увольнении не отберут.

Успехов!

С уважением, Владислав Мозгалев