В соответствии со статьями 38, 39 Семейного кодекса РФ разделу между супругами подлежит только общее имущество,
нажитое ими во время брака.
Средства мат.капитала имеют специальное целевое назначение, не являются совместно нажитым имуществом супругов и не могут быть разделены между ними.
При определении долей родителей и детей в праве собственности на жилое помещение, приобретенное с использованием средств мат.капитала, необходимо руководствоваться ч. 4 ст. 10 ФЗ от 29.12.2006 г. № 256-ФЗ, а также положениями ст. 38, 39 Семейного кодекса РФ.
Определение долей в праве собственности на такую квартиру должно производиться исходя из равенства долей родителей и детей на средства материнского (семейного) капитала, потраченные на
приобретение этой квартиры, а не на средства, за счёт которых она была приобретена, т.е. на родителей, находящихся в браке в период покупки квартиры с использованием мат.капитала, и их детей в равных долях делится только часть квартиры, соразмерная по стоимости средствам мат.капитала, остальная часть является общим имуществом супругов. Об этом был сделан соответствующий вывод в Определении Верховного Суда РФ от 26.01.2016 г. № 18-КГ 15-224.
Таким образом, квартира, приобретенная с использованием средств мат.капитала, не является полностью общим имуществом супругов. Та ее часть, которая по стоимости соответствует средствам мат.капитала, не является общим имуществом супругов и не подлежит разделу между ними по правилам раздела общего имущества супругов, а подлежит разделу между родителями и детьми в равных долях.
В Вашей ситуации, если Ваш бывший супруг, состоящий с Вами в браке на момент приобретения квартиры, желает отказаться от той доли квартиры, которая должна быть ему выделена пропорционально размеру мат.капитала, он может оформить отказ от реализации своего права на участие в определении долей в квартире, приобретенной с использованием средств материнского капитала, в части размера мат.капитала.
Направление средств материнского (семейного) капитала на улучшение жилищных условий регулируются Правилами направления средств мат.капитала на улучшение жилищных условий, утв. Постановлением Правительства РФ от 12.12.2007 г. N 862. Реализация данного права участвовать в определении долей в квартире не является обязанностью граждан, в связи с чем Ваш бывший супруг может оформить нотариальный отказ именно от реализации права на участие в определении долей в квартире в части распределения средств мат.капитала.
Но мы же после расторжения брака оформили нотариально соглашение о разделе имущества, в котором он отказывается от доли, если он отказался, зачем снова оформлять долю, логики ни какой?
Все верно, он распорядился своей долей, подписав соглашение о разделе имущества.