Здравствуйте, может ли отец ребёнка, иностранный гражданин, находясь заграницей препятствовать в получении ребёнком Российского загран паспорта

Здравствуйте,  Ольга!  В получении самого паспорта он никак не может препятствовать,  в вот препятствовать выезду из РФ да. 

Согласно ч. 1 ст 21 Федерального закона от 15.08.1996 N 114-ФЗ

В случае, если один из родителей, усыновителей, опекунов или попечителей заявит о своем несогласии на выезд из Российской Федерации несовершеннолетнего гражданина Российской Федерации, вопрос о возможности его выезда из Российской Федерации разрешается в судебном порядке. разрешается в судебном порядке.

То есть,  отцу ребенка достаточно подать заявление о своем несогласии на выезд ребенка из РФ в порядке, установленном МВД России. 

Здравствуйте,

Отец ребенка может воспрепятствовать получению заграничного паспорта.

Вы пишете:

 Он не сможет подать заявление в РФ, так как он является гражданином другой страны. 

Чтобы подать заявление о несогласии на выезд ребенка, гражданство РФ не нужно, оно подается по месту жительства ребенка или по месту жительства родителей.

Согласно п.1 Порядка подачи, рассмотрения и ведения учета заявлений о несогласии на выезд из Российской Федерации несовершеннолетнего гражданина Российской Федерации

Прием и учет заявлений осуществляется подразделениями по вопросам миграции территориальных органов МВД России на региональном и районном уровнях по месту жительства (пребывания) одного из родителей, усыновителей, опекунов или попечителей несовершеннолетнего гражданина Российской Федерации или несовершеннолетнего гражданина Российской Федерации, в отношении которого подается заявление.
Прием и учет заявлений осуществляется дипломатическими представительствами или консульскими учреждениями Российской Федерации по месту постоянного проживания заявителя за пределами Российской Федерации.

Обращение с таким заявлением препятствует получению заграничного паспорта. Наличие сведений  о несогласии законного представителя на выезд из Российской Федерации несовершеннолетнего гражданина Российской Федерации являются основаниями  для отказа в оформлении и (или) выдаче заграничного паспорта (п. 52.1.2. и 52.2.1. Административного регламента МВД РФ  по предоставлению государственной услуги по оформлению и выдаче паспортов гражданина Российской Федерации, удостоверяющих личность гражданина Российской Федерации за пределами территории Российской Федерации, утв. Приказом МВД России от 16.11.2017 №864).

 Он грозится подать иск в своей стране об убытии ребенка

Если речь об иске о возвращении ребенка в страну постоянного проживания, он подается в той стране, куда ребенок вывезен. В стране, из которой ребенок был вывезен, можно подать иск об опеке над ребенком.

сможет ли иск, поданный в другой стране быть препятствием на получение загранпаспорта РФ? Эти системы учёта как то между собой связаны?

Нет. Что может быть препятствием для получения паспорта я ответил выше. Что касается последствий перемещения ребенка и возможностей отца — ситуацию нужно разбирать более детально, стоимость такой консультации явно выше установленной вами суммы.

С уважением, Андрей Козырев