Как доказать отсутствие убытков?

Считаю, что в данной случае истец может требовать только неустойку за просрочку поставки товара, а убытки — не могут быть взысканы.

Альфия

В данном случае истцом должен быть доказан размер причиненного ему вреда — а именно необходимость в приобретении заявленного объема продукции, в связи с допущенными Вами нарушениями срока ее поставки и по указанной цене (поскольку возможно было приобрести товар при схожих условиях, но за меньшую цену).

Здесь стоит учесть, что в силу ст. 520 ГК РФ на которую собственно и сделана ссылка в иске

1. Если поставщик не поставил предусмотренное договором поставки количество товаров либо не выполнил требования покупателя о замене недоброкачественных товаров или о доукомплектовании товаров в установленный срок, покупатель вправе приобрести непоставленные товары у других лиц с отнесением на поставщика всех необходимых и разумных расходов на их приобретение.
Исчисление расходов покупателя на приобретение товаров у других лиц в случаях их недопоставки поставщиком или невыполнения требований покупателя об устранении недостатков товаров либо о доукомплектовании товаров производится по правилам, предусмотренным пунктом 1 статьи 524 настоящего Кодекса.

Правда, стоит обратить внимание на то, что в данном случае в качестве основания приобретения товара у стороннего продавца законом называется неисполнение обязанности поставщика по поставке товара.

В Вашем случае имело место нарушение срока — но сама обязанность при этом была исполнена.

И в этом случае, Вы можете возражать против заявленных требований тем, что получив поставленный с нарушением срока товар и требуя компенсацию за ранее им приобретенный у истца может возникнуть неосновательное обогащение.

В этой связи получатель мог бы, основываясь на ст. 523 ГК РФ могу бы отказаться от получения товара и требовать расторжения договора в связи с нарушением сроков поставки, а также в силу ст. 524 ГК РФ в случае его расторжения потребовать бы компенсацию понесенных расходов. 

Кроме того, как уже отметил для того чтобы взыскать расходы на приобретение товаров у других лиц по п. 1 ст. 520 ГК РФ (в связи с ненадлежащим выполнением поставщиком своих обязанностей), покупатель должен доказать, что такие расходы являются разумными.

Однако в отдельных случаях на практике признается возможность заключения сделки с третьим лицом и до расторжения договора, тем более если такая возможность предусмотрена и в Вашем договоре поставки.

В частности, в определение Верховного Суда РФ от 24.05.2019 N 309-ЭС19-6546 по делу N А76-39836/2017

было отмечено, что 

При этом судом первой инстанции было установлено, что условиями договора предусмотрена, как ответственность поставщика в случае нарушения сроков поставки товара, так и право покупателя приобрести непоставленные товары у третьих лиц с отнесением на поставщика всех необходимых расходов на их приобретение, который обязался их возместить.

Покуптаель нам не сообщал о приобретении товара у другого поставщика, а спустя полтора года подал иск

Для отзыва Вам очень пригодится вот этот Пленум Верховного суда:

Постановление Пленума Верховного Суда РФ от 24.03.2016 N 7
«О применении судами некоторых положений Гражданского кодекса Российской Федерации об ответственности за нарушение обязательств»

А именно раздел «Возмещение убытков при прекращении договора (статья 393.1 ГК РФ)»

В частности, как указывал Верховный суд РФ:

13. Заключение замещающей сделки до прекращения первоначального обязательства не влияет на обязанность должника по осуществлению исполнения в натуре и на обязанность кредитора по принятию такого исполнения (пункт 3 статьи 308 ГК РФ). Кредитор вправе потребовать от должника возмещения убытков в виде разницы между ценами в первоначальном договоре и такой замещающей сделке при условии, что впоследствии первоначальный договор был прекращен в связи с нарушением обязательства, которое вызвало заключение этой замещающей сделки.

А раз покупатель не прекратил обязательства по причине просрочки, и принял товар, то можно говорить, что оснований для убытков от замещающей сделки нет.

Вам необходимо направить отзыв на исковое заявление в арбитражный суд, в котором вы изложите свои доводы.

В силу ст. 131 АПК РФ

Ответчик обязан направить или представить в арбитражный суд и лицам, участвующим в деле, отзыв на исковое заявление с указанием возражений относительно предъявленных к нему требований по каждому доводу, содержащемуся в исковом заявлении.

они закупили ее у других поставщиков по более дорогой стоимоости

Альфия

Вот это ключевой момент — факт закупки товара по более дорогой цене. Вы не знакомились с материалами дела? Есть ли в деле доказательства, подтверждающие факт покупки товара у юридических лиц на сумму 2 651 405,20 руб.? Если таких доказательств нет, то факт убытков не доказан, что уже является основанием для отказа в иске.

В приложении к иску договоры с другими компаниями не указаны.

Постановление Пленума Верховного Суда РФ от 23.06.2015 N 25 «О применении судами некоторых положений раздела I части первой Гражданского кодекса Российской Федерации»

12. По делам о возмещении убытков истец обязан доказать, что ответчик является лицом, в результате действий (бездействия) которого возник ущерб, а также факты нарушения обязательства или причинения вреда, наличие убытков (пункт 2 статьи 15 ГК РФ).