Здравствуйте, Евгений.
К сожалению, законодательство об алиментах «не заточено» под такие ситуации. Доход будет считаться полученным в том месяце, когда он выплачен фактически, а не за период, который оплачен.
Вполне может быть такое, что на учет в центр занятости Вас поставят, но пособие платить не будут за тот период, что оплатил работодатель, а алименты пристав рассчитает из средней зарплаты по стране.
Возьмите у работодателя подписанный и с печатью расчетный листок за последний месяц работы и увольнения, может там будет указано, за какие периоды начисления сделаны и попробуйте приставу это все объяснить в письменном заявлении.
Если пристав не внемлет, придется обжаловать в суд или смириться.