Если ли заказчик подписал договор лично и мне отправил оригинал, а я его подписал электронной подписью и ему отправил, имеет ли это юридическую силу?

Добрый вечер, МИлан!

Безусловно имеет договор юридическую си и не важно, что у вас по разному он подписан.

ГК РФ Статья 160. Письменная форма сделки

1. 
Письменная форма сделки считается соблюденной также в случае совершения лицом сделки с помощью электронных либо иных технических средств, позволяющих воспроизвести на материальном носителе в неизменном виде содержание сделки, при этом требование о наличии подписи считается выполненным, если использован любой способ, позволяющий достоверно определить лицо, выразившее волю.