Добрый день! Если ваш руководитель обвиняет вас именно в краже, а сотрудница подтверждает, что в ее присутствии он вам передал деньги, то здесь нет состава кражи, поскольку кража- это тайное хищение чужого имущества. Тогда, по сути, начальник должен вас обвинять в присвоении или растрате, но не краже. Из вашего вопроса непонятно, уголовное дело заведено или нет. Если да, то вам надо активно защищаться, и без хорошего адвоката не советую вам отвечать на какие-либо вопросы следователя, воспользуйтесь ст. 51 Конституции РФ — никто не обязан свидетельствовать против себя самого… Если начальник подал заявление, а вы знаете, что такого факта не было, вам нужно написать заявление на начальника о привлечении его к уголовной ответственности по ст. 306 УК РФ — заведомо ложный донос, и в заявлении указать все обстоятельства дела, и если были сексуальные домогательства, то это ст. 133 УК РФ — принуждение к действиям сексуального характера, все это нужно описать в заявлении. Если будет доказано, что донос вашего начальника на вас действительно ложный, и доказаны сексуальные домогательства вступившим в законную силу приговором суда — то тогда требовать от виновного возмещения морального вреда, подав гражданский иск.