Подскажите, насколько это страшно?

В принципе закон не обязывает нумеровать как то пункты, и не устанавливает правило, что в подобном случае соглашение недействительно.

Кроме того, в силу ГК РФ (ст. 431)

При толковании условий договора судом принимается во внимание буквальное значение содержащихся в нем слов и выражений. Буквальное значение условия договора в случае его неясности устанавливается путем сопоставления с другими условиями и смыслом договора в целом. 

Поэтому имеет значение содержание положений этого соглашения а не их нумерация.