Здравствуйте, Юрий.
В целом такое разделение бизнеса законом не запрещено, тем более что ИП не вправе торговать крепким алкоголем, потому открытие алкогольного магазина на ООО вполне экономически обоснованно.
Главное в своей деятельности не допускать поведения, которое может быть признано налоговой как неправомерное дробление бизнеса с целью получения необоснованной налоговой выгоды участниками такого дробления.
Признаки незаконного дробления изложены в Письме ФНС России от 11.08.2017 N СА-4-7/15895@, можете ими руководствоваться.
Что касается выбора конкретной системы налогообложения, то выбор стоит между общей и упрощенной системой налогообложения («доходы» или «доходы минус расходы»).
Общая система налогообложения – это налоговый режим, при котором организации и ИП платят все предусмотренные законодательством налоги и сборы в полном размере, а также должны вести вести полный бухгалтерский и налоговый учёт.
При упрощенной системе (ст.346.11 Налогового кодекса) организации не платят налог на прибыль, налог на имущество организаций, НДС (кроме таможенного), а ИП не платят НДФЛ, налог на имущество физлиц в отношении предпринимательского имущества, НДС (кроме таможенного).
Выбор зависит от размера расходов (на закупку товаров, аренду, выплату з/п работникам и т.п.) в Вашей деятельности, у каких поставщиков Вы закупаете товар (плательщиков НДС или нет), от ставки налога в регионе ведения деятельности (для УСН-«доходы минус расходы»). То есть нужны конкретные (предполагаемые) цифры Ваших доходов и расходов, тогда можно подсчитать наиболее выгодную систему налогообложения.
Есть специальные калькуляторы налоговой нагрузки, вот например: https://www.kontur-extern.ru/i... , можете их использовать для определения наиболее выгодной системы.
С уважением, Роман.