Как может повлиять это при получении нового жилья

Здравствуйте, Валентина!
Не повлияет, поскольку собственник будучи не зарегистрированным в таком жилом помещении, не утрачивает право собственности на такое жилое помещение и вправе распоряжаться им. Как я понимаю речь идет о жилом помещении (комнате), которая находится в долевой собственности.
Правоотношения, связанные с обеспечением жилищных прав собственника жилого помещения при изъятии земельного участка для государственных или муниципальных нужд регулируются ст. 32 Жилищного кодекса РФ.
При переселении с собственником заключается Соглашение, предметом которого устанавливается возмещение (в денежной форме либо в виде предоставления равноценного жилого помещения).
С уважением