Какие нужны документы для подачи в суд чтобы выписать отца из свидельства о рождении у ребенка (не является отцом, был записан автоматически) и вписать биологического отца

В силу требований ст.52 СК РФ

оспаривание отцовства возможно лишь в судебном порядке.

Согласно ст. 69 Закона «Об актах гражданского состояния»

основанием для внесения исправлений и изменений в записи актов гражданского состояния является решение суда.

По общему правилу, иск предъявляется в районный суд по месту жительства ответчика, госпошлина составит 300 руб., квитанцию об оплате которого следует приложить к заявлению, копии свидетельства о рождении ребенка, свидетельства о расторжении брака, доказательства, которые  с достоверностью подтверждающие происхождение ребенка от биологического отца, которыми вы располагаете.