Как сейчас объяснить ИФНС то что на карту переводил ИП не является доходом

Здравствуйте  Оля! 

Собственник вправе по своему усмотрению совершать в отношении принадлежащего ему имущества любые действия (п. 2 ст. 209 ГК РФ). То есть индивидуальный предприниматель вправе самостоятельно принимать решения о расходовании денежных средств, в том числе снять их с расчетного счета для личных нужд или перевести на личный счет. Как известно, применение упрощенной системы налогообложения или единого налога на вмененный доход  освобождает индивидуальных предпринимателей от обязанности уплачивать налог на доходы физических лиц (п. 3 ст. 346.11 НК РФ, п.4 ст. 346.26 НК РФ) в отношении доходов, полученных от предпринимательской деятельности. 

Индивидуальный предприниматель, применяющий упрощенную систему налогообложения, вносит  на   расчетный  счет  свои личные денежные средства. доходом при исчислении налога  они  признаваться не  будут . 

доходами  признаются (ст. 346.17 НК РФ) на момент:

получения оплаты от покупателя на расчетный счет или в кассу;

 При определении налоговой базы в связи с уплатой упрощенной системы налогообложения учитываются только доходы от реализации от реализации и внереализационные доходы. А собственные средства индивидуального предпринимателя, которые он положил на свой счет, не могут быть признаны доходом, так как они не связаны с реализацией или с операциями, указанными в статье 250 НК РФ. Отсюда следует, что личные деньги предпринимателя, вносимые в кассу, не облагаются ни налогом на доходы физических лиц, ни единым налогом.

Подробнее см. по ссылке https://www.nalog.gov.ru/rn40/news/tax_doc_news/6076790/

Из всего этого ИП зарабатывала только 3%. Сейчас ИФНС требует книгу покупок и продаж по отчету 3 ндфл

 Оля, добрый день! При применении ОСНО указанные платежи в пользу водителей надо относить к расходам, уменьшающим налоговую базу. на основании ст. 221 НК РФ согласно которой  
при исчислении налоговой базы в соответствии с пунктом 3 статьи 210 настоящего Кодекса право на получение профессиональных налоговых вычетов имеют следующие категории налогоплательщиков:
 

1) налогоплательщики, указанные в пункте 1 статьи 227 настоящего Кодекса, — в сумме фактически произведенных ими и документально подтвержденных расходов, непосредственно связанных с извлечением доходов, но не более суммы таких доходов от осуществления предпринимательской деятельности.

При УСН, например, такие поступления (выплаты агента в пользу принципалов не включаются в налоговую базу на основании п.п. 9 п. 1 ст. 251 НК РФ при наличии соответствующих договоров подтверждающих наличие агентских отношений с водителем. Но если водители не являются ИП/самозанятыми у Вас возникает другая проблема — в описанной ситуации на Вас лежит обязанность уплаты страховых взносов в случае выплат в пользу таких водителей. 

Здравствуйте, Ольга. 

Вообще, конечно, следует представлять наглядно схему Вашей работы, видеть договоры и оферты, по которым Вы работаете. Если исходить из того, что Вы агент, получающий деньги на расчетный счет от Яндекс.такси и исполняющий функции агента в расчетах, то в пояснениях в налоговый орган указать, что средства, перчисляемые водителям, полученные Вами на свой счет от Яндекс.такси, не являются Вашим доходом в силу пп.9 п.1 ст.251 НК РФ

1. При определении налоговой базы не учитываются следующие доходы:

.....

9) в виде имущества (включая денежные средства), поступившего комиссионеру, агенту и (или) иному поверенному в связи с исполнением обязательств по договору комиссии, агентскому договору или другому аналогичному договору, а также в счет возмещения затрат, произведенных комиссионером, агентом и (или) иным поверенным за комитента, принципала и (или) иного доверителя, если такие затраты не подлежат включению в состав расходов комиссионера, агента и (или) иного поверенного в соответствии с условиями заключенных договоров. К указанным доходам не относится комиссионное, агентское или иное аналогичное вознаграждение;

Указанного мнения придерживается и Минфин в своих разъясняющих Письмах 02.02.2016 г №03-11-06/2/4733, от 20 февраля 2012 года № 03-11-11/49, к пояснениям приложить документы, характеризующую схему Вашей работы. 

Сейчас ИФНС требует книгу покупок и продаж по отчету 3 ндфл.

Вероятно, Вы не верно сформулировали. Так не бывает. 3-НДФЛ обязаны подавать сами физические лица. Возможно с Вас требуют книгу учета доходов и отражения в ней всех денежных средств, поступивших на счет от Яндекс.такси. Вам же нужно доказать, что перечисления как раз и связаны с исполнением Вами функций агента. а также отражения средств, перчисленных водителям, в отчетах 6-НДФЛ.

При этом, как  агент в гражданско-правовых отношениях с водителями, Вы не являетесь их налоговым агентом по смыслу ст.226 НК РФ, поэтому никакого отношения к НДФЛ не имеете.

Подробная консультация с изучением требования налогового органа, изучением документов, характеризующих схему Вашей работы и составление пояснений возможна в рамках индивидуальной консультации в чате. В формате «вопрос-ответ» провести такую работу не представляется возможным.

С уважением