Будет ли иметь приложение юридическую силу при поставленной печати обоих сторон

Здравствуйте, Николай. 

Это приложение является формой акта, подпись под приложением будет означать, что сторонами согласована форма. Однако следует отметить, что обычно сама форма не подписывается сторонами. После раздела с подписями сторон, обычно, должна быть графа «форма согласована» под ней Вы соответственно и должны расписаться. Таким образом, при подписании рекомендую ручкой дописать, что Вы своей подписью согласовываете именно форму, а не подписываете непосредственно акт. 

С уважением, Щепин Александр Алексеевич!