Согласно п.43 Постановления Правительства РФ от 17.12.2010 г. N 1050 «О реализации отдельных мероприятий государственной программы Российской Федерации „Обеспечение доступным и комфортным жильем и коммунальными услугами граждан Российской Федерации“
приобретаемое жилое помещение или построенный жилой дом оформляются в общую собственность всех членов семьи, указанных в свидетельстве о праве на получение социальной выплаты
Следует полагать, поскольку вы в период участия в госпрограмме состояли в браке, то бывший супруг был включен с список на получение социальной выплаты, соответственно и вправе требовать выделения ему доли.
В соответствии с п. 2 ст. 34 СК РФ квартира не является общим имуществом супругов (т.к. имеет специальное целевое назначение, учитывая, что квартира получена в результате субсидии — по безвозмездной целевой выплате), значит, попадает под действие ст. 36 СК РФ и разделу не подлежит.Следовательно, бывший супруг не может претендовать на выделение ему доли.