Если номера утилизированы странным образом, то на кого еще стоит ограничение?

Авто было в кредите?

Признать номера недействительными могли только в случае, если автомобиль был снят с учета, в ином случае это сделать не представляется возможным.

НА это указано в постановление  Правительства РФ от 21.12.2019 N 1764

При прекращении государственного учета транспортного средства в соответствии с пунктом 57 настоящих Правил государственные регистрационные знаки и регистрационные документы признаются недействительными и вносятся регистрационным подразделением в соответствующие разыскные учеты утраченной специальной продукции Госавтоинспекции по истечении 10 дней со дня отчуждения транспортного средства.

Но речь идет о снятии с учета при отчуждении прошлого владельца по истечении 10 дней после его продажи. 

Могу лишь допустить, что на время ограничения в регистрационных действий было снято, что и позволили снять автомобиль с регистрационного учета.

Тут изначально нужно обращаться в ГИБДД за получением сведений о наложенных ограничений и основания их наложения, а таже уточнении сведений о том, снимались ли данные ограничения или нет.

Пока на автомобиль наложены ограничения регистрационные действия в отношении него не могли быть совершены, а в этом случае, если ограничения имели место то, не могли признать недействительными номера.