Возникает вопрос, если пройдет год-два и жена решить запросить накопленную сумму, имеет ли она право также запросить пени?

Здравствуйте! Да, она может взыскать неустойку.

СК РФ Статья 115. Ответственность за несвоевременную уплату алиментов

2. При образовании задолженности по вине лица, обязанного уплачивать алименты по решению суда, виновное лицо уплачивает получателю алиментов неустойку в размере одной десятой процента от суммы невыплаченных алиментов за каждый день просрочки.

Доброго времени суток, Виталий!
Отказ от алиментов действующим семейным законодательством Российской Федерации не допускается. Этого не можете сделать ни Вы, ни Ваша супруга, даже действуя как законный представитель ребенка. При этом следует понять как уплачиваются алименты, точнее на основании чего: Соглашения об уплате алиментов или судебного акта.

Начисление неустойки при этом по закону возможно, это следует из положений статьи 115 Семейного Кодекса Российской Федерации. Но ключевое что следует отметить, что она начисляется, если несвоевременная уплата алиментов осуществлена по вине лица, обязанного уплачивать алименты.
В Вашем случае что следует точно закрепить — это факт осуществления переводов (банковские чеки или квитанции, подтверждающие оплату, также в назначении платежа можно указать, что средства направляются на алименты). 
Далее продолжу. 

Добрый день.

Она не могла написать отказ от алиментов, так как это незаконно и нарушает права ребенка. Алименты предназначаются ему, а не ей.

Ваш конфликт с бывшей женой никак на это не влияет.

Поэтому, есть 2 варианта:

1. Заключить соглашение об оплате алиментов.

2. помириться и продолжать платить в прежнем порядке.

Если она будет продолжать возвращать деньги, которые вы перечисляете, то вы можете подать жалобу на нее в органы опки, мотивируя это тем, что она препятствует вам финансово обеспечивать ребенка.

Приложите выписки где отражен факт перевода и факт возврата денег.

УК РФ Статья 157. Неуплата средств на содержание детей или нетрудоспособных родителей
1. Неуплата родителем без уважительных причин в нарушение решения суда или нотариально удостоверенного соглашения средств на содержание несовершеннолетних детей, а равно нетрудоспособных детей, достигших восемнадцатилетнего возраста, если это деяние совершено неоднократно, -

За неуплату алиментов предусмотрена уголовная ответственность.

Так что если супруга хочет вас подставить, то может подать заявление через какое то время, если у вас заключено соглашение или имеется решение суда

Добрый день, Виталий.

Исхожу из того, что алименты взысканы судебным решением либо заключено алиментное соглашение.

стал откладывать данную сумму на отдельный счет (свой)

 Такой способ не является исполнением алиментных обязательств. В силу п.2 ст.60 СК РФ

2. Суммы, причитающиеся ребенку в качестве алиментов, пенсий, пособий, поступают в распоряжение родителей (лиц, их заменяющих) и расходуются ими на содержание, воспитание и образование ребенка.

В Вашем же случае алименты вообще никуда не перечисляются, они остаются в Вашем распоряжении, на вашем счете, поэтому Вас нельзя считать надлежаще исполняющим свои алиментные обязательства.

Возникает вопрос, если пройдет год-два и жена решить запросить накопленную сумму, имеет ли она право также запросить пени ?

 Исходя из п.1 и п.2 ст.115 СК РФ услвоием для начисления неустойки является наличие вины плательщика алиментов в их неуплате. При этом согласно ст.401 ГК РФ именно на Вас будет лежать обязанность доказать отсутствие вины. И откладывание денег на счет исключающим вину обстоятельством признаваться не будет.

последующие платежи она вернула обратно (на карту)

 Во-первых, сомневаюсь, что в назначении платежа указано — возврат алиментов. Во-вторых, это не основание не платить алименты

На словах сказала, что написала отказ от алиментов,

 На словах можно сказать много чего, отказ от алиментов недопустим, не предусмотрен.

При отказе супруги получать деньги Вы вправе вносить денежные средства в депозит нотариуса в соответствии с пп.4 п.1 ст.327 ГК РФ, это надлежащее исполнение обязательства

1. Должник вправе внести причитающиеся с него деньги или ценные бумаги в депозит нотариуса, а в случаях, установленных законом, в депозит суда — если обязательство не может быть исполнено должником вследствие:

....

4) уклонения кредитора от принятия исполнения или иной просрочки с его стороны.

Согласно ст.87 Основ законодательства о нотариате

О поступлении денежных средств и ценных бумаг нотариус извещает кредитора и по его требованию выдает ему причитающиеся денежные средства и ценные бумаги.

О внесении денег в качестве алиментов в депозит нотариус выдает Вам справку, с этого момента Вы считаетесь исполнившим свои обязанности