И вообще, может вы сможете что-нибудь подсказать?

Здравствуйте

Вообще-непонятно на каком основании вам отказали в принятии документов на РВП в Омске, если у вас- гражданки России,  именно в Омске имеется регистрация по месту жительства (т.н. «постоянная» регистрация)

Поскольку в соответствии  с подпунктом 4 пункта 3 статьи 6 Федерального закона " О правовом положении иностранных граждан в РФ", РВП по браку оформляется 

  в субъекте Российской Федерации, в котором расположено место жительства гражданина Российской Федерации, являющегося его супругом (супругой);

http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_37868/c9b9574537c49598dac3a13845550e8995a3f405/

 нужно было немедленно подавать жалобу на отказ в приеме документов в Управление МВД России по Омской области согласно п.205.1 Приказа МВД России от 11.06.2020 N 417  «Об утверждении Административного регламента Министерства внутренних дел Российской Федерации по предоставлению государственной услуги по выдаче иностранным гражданам и лицам без гражданства вида на жительство, замене иностранным гражданам и лицам без гражданства вида на жительство в Российской Федерации»

http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_356743/5c48513106d731050b089933606f64030f19dd2a/

 вопрос давно был решён

 продолжу ответом далее

Здравствуйте, Анастасия.

Боюсь, вариантов у Вас нет. 

Вы указываете

Прилетели в Омск( по месту моей прописки, как было сказано), нам отказали

 но не написали, почему отказали, возможно, стоило оспорить отказ, если он был незаконный. Если же отказ был потому, что на тот момент Вы не были в браке, почему-то же Вы упомянули  

мы зарегистрировали брак.

 то я не вижу иного варианта, как опять ехать в Омск, при условии, что Вашему мужу в первый раз отказали сразу же в приеме документов, а не именно в выдаче РВП, так как повторное обращение за РВП после отказа в выдаче  возможно только через год (п.6 ст. 6 Федерального закона от 25.07.2002 N 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации»).

Но учитывая, что до 9 марта только 2 рабочих дня (6,7 марта), вряд ли физически можно успеть подготовить и подать документы. 

Чтобы посмотреть

есть ли возможность как-нибудь не выезжать из страны и продлить визу здесь?

 нужно хотя бы знать, что за виза, какой категории, на какой срок, сколько дней по ней было пребывание. 

Вы упоминаете университет и академический отпуск, поэтому предполагаю, что виза учебная.

На время академического отпуска договор на обучение не расторгается, образовательные правоотношения не прекращаются, поэтому продление визы возможно

111. Иностранному гражданину, въехавшему в Российскую Федерацию для обучения в организации, осуществляющей образовательную деятельность, обыкновенная учебная виза продлевается подразделением по вопросам миграции по месту постановки на миграционный учет по месту пребывания иностранного гражданина путем выдачи многократной визы на период обучения, но не более чем на один год для каждой последующей визы.

Приказ МВД России от 04.12.2019 N 907 «Об утверждении Административного регламента Министерства внутренних дел Российской Федерации по предоставлению государственной услуги по оформлению, выдаче, продлению срока действия и восстановлению виз иностранным гражданам и лицам без гражданства» 

В соответствии с пунктом 7 статьи 5 Федерального закона N 115-ФЗ обязанность по предоставлению в территориальный орган МВД России документов, необходимых для продления срока временного пребывания иностранных студентов, возложена на образовательную организацию.

Однако, вузу нужно было обратиться с ходатайством о продлении срока временного пребывания в Российской Федерации иностранного гражданина, обучающегося в ней, не позднее чем за двадцать дней до окончания срока его временного пребывания в Российской Федерации. Тоже уже поздно.