Пришла повестка сыну, но его нет в стране, нужно ли звонить в военкомат и объяснять причины отсутствия

Повестка должна быть вручена только лично в руки под роспись. Тогда, когда соблюдены правила ее вручения, то есть когда повестка вручена лицом, уполномоченным на это, и лично в руки призывнику под его расписку (п. 7 Положения о призыве).

Анна, здравствуйте, никуда звонить не нужно, повестка вручается лично и под роспись.

Здравствуйте, Анна! 

Здесь сама повестка должна быть вручена только в руки и под роспись. Только тогда будут соблюдены сами правила вручения такой повестки, когда она будет вручена тому лицу который уполномочен получить такую повестку. Вам никуда звонить будет не нужно, так как сама повестка тут будет вручена тому человеку кто уполномочен и имеет право получить такую повестку. Только тогда будет вручена сама повестка.