Рекомендации врача являются ли для командира основанием чтобы отпустить военнослужащего на операцию?

Согласно ст. 362 Устава внутренней службы Вооруженных Сил Российской Федерации, утвержденного Указом Президента РФ от 10 ноября 2007 г. N 1495, на стационарное лечение вне расположения воинской части военнослужащие направляются по заключению врача командиром воинской части, а для оказания неотложной помощи в отсутствие врача — дежурным фельдшером (санитарным инструктором) с одновременным докладом начальнику медицинской службы и дежурному по воинской части...

Основанием для приема военнослужащего военно-медицинской организацией, медицинской частью, медицинской организацией государственной или муниципальной системы здравоохранения для оказания медицинской помощи в стационарных условиях является представление таким лицом направления на госпитализацию, заверенного печатью воинской части, а также документа, удостоверяющего личность.

Таким образом, только в экстренных случаях Вас могут направить на операцию минуя командира.