Расчет 6-НДФЛ нужно подать, если у сотрудников были удержания по НДФЛ с перечислением в бюджет, т.е. если работодатель начислял доходы своим сотрудникам.
Отчет по форме СЗВ-М должны сдавать все работодатели независимо от того, начислялись ли доходы сотрудникам или нет. В форму СЗВ-М должны включаться сведения обо всех сотрудниках, которые выполняют работу у данного работодателя как на основании трудовых, так и на основании гражданско-правовых договоров независимо от того, вела организация фактическую деятельность или нет, были выплаты сотрудникам в отчетном периоде или нет.
Исходя из того, что по отчету 6-НДФЛ и СЗВ-М имеются расхождения в части указания нулевых отчетов по 6НДФЛ при наличии 12 сотрудников по отчету СЗВ-М, можно сделать вывод о том, что в отчетном периоде указанным сотрудникам не осуществлялось начисление заработной платы, в связи с чем также не было отчислений по НДФЛ в бюджет.
Таким образом, если в организации имеются сотрудники, отчет по форме СЗВ-М не может быть нулевым, но если им в отчетном периоде не осуществлялось начислений и не было дохода, соответственно, не было отчисления по НДФЛ, то сведения в отчете 6НДФЛ будут отличаться от сведений в отчете по форме СЗВ-М.
В соответствии с п. 3 ст. 88 НК РФ
Если камеральной налоговой проверкой выявлены противоречия между сведениями, содержащимися в представленных документах, либо выявлены несоответствия сведений, представленных налогоплательщиком, сведениям, содержащимся в документах, имеющихся у налогового органа, и полученным им в ходе налогового контроля, об этом сообщается налогоплательщику с требованием представить в течение пяти дней необходимые пояснения или внести соответствующие исправления в установленный срок.
В случае непредставления этих объяснений, доказывающих достоверность сведений, налогового агента могут оштрафовать по ст. 126.1 НК РФ.
Исправлять допущенные ошибки в 6-НДФЛ следует путём сдачи уточнённого расчёта.
Уточнённый расчёт 6-НДФЛ необходимо представить, если в ранее направленном в инспекцию документе не отражены нужные сведения, они отражены не полностью или в документе содержится недостоверная информация.
Для определения в каких отчетах и какие данные подлежат корректировке надо эти отчеты видеть, т.е их надо прикрепить.
После исправления неточностей в отчетах, можно написать что ошибки исправлены и направлены отчеты с корректировкой 1