Может ли собственник квартиры аннулировать прописку несобственника, прописанного в этой же квартире без согласия несобственника?

Здравствуйте, согласно п. 1 ст. 35 ЖК РФ выписать человека из квартиры без его согласия можно только через суд

Михаил!

Собственник квартиры сам ничего аннулировать не может, по правилам Жилищного Кодекса РФ собственник может просить суд признать прописанного в квартире человека утратившим право пользования квартирой. Вопрос будет решаться в судебном порядке, самостоятельно принять решение собственник не может, лишить человека права пользования квартирой можно только через суд, каждая сторона должна привести доводы в поддержку её позиции.

Всего доброго!

Добрый день! 

Полагаю, что под термином аннулировать, вы подразумеваете снятие с миграционного учета. В таком случае человек сам должен обратиться с заявлением в отделение МФЦ или управление МВД о снятие его с миграционного учета. 

Если нужно снять его принудительно, то там другой порядок, напишите если у Вас такой случай, я распишу какие действия нужно будет предпринять.