Ибо я по сути могу подтвердить статус соотечественника?

Здравствуйте, Алексей.

у моих родителей есть свидетельство о браке в СССР, плюс мать была гражданкой СССР

 это не делает Вас однозначно «соотечественником» в том смысле, какой придается этому термину  в ст. 1 Федерального закона от 24.05.1999 N 99-ФЗ «О государственной политике Российской Федерации в отношении соотечественников за рубежом».

Информации не достаточно, чтобы сделать такое заключение: Вы не указали, проживали ли Ваш отец или мать (или может быть дед/ бабка с любой стороны) постоянно на территории, которая сейчас входит в РФ до распада СССР или еще на территории Российской империи. Если нет, то Вы не можете участвовать в Госпрограмме переселения соотечественников или быть признанным носителем русского языка.  Если кто-то из родственников по прямой восходящей линии проживал, надо смотреть, какие есть документы, подтверждающие этот факт (это уже за рамками данной консультации, у Вас и так достаточно обширный вопрос для такого скромного гонорара: после удержания комиссии сайтом — 630 руб. на трех юристов, один из которых эксперт).

Как я знаю, в РФ можно находиться 90 дней.

 в течение 180 дней с даты въезда. 

Я думаю въезжать по причине — работа, оформить патент и устроиться куда-нибудь. 

 полагаю, Вы знаете, что за оформлением патента необходимо обратиться  в течение 30 календарных дней со дня въезда в РФ, а также в течение двух месяцев со дня получения патента необходимо представить в уполномоченный орган, выдавший патент, копию трудового договора или гражданско-правового договора на выполнение работ/оказание услуг. Документы можно подать лично либо направить заказным почтовым отправлением с уведомлением о вручении (п.п.2, 2.2, 7 ст. 13.3 Федерального закона от 25.07.2002 N 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации»).

Далее продлевать на основании патента свою миграционную карту

продлевается не миграционная карта, а  миграционный учет по месту пребывания на том основании, что при оплате авансового платежа по НДФЛ (который ошибочно часто считают оплатой патента) продлевается срок временного пребывания. 

Следует строго следить за тем, чтобы платить авансовый платеж вовремя. Просрочка даже на 1 день ведет к аннулированию патента (п. 22 ст. 13.3 закона №115-ФЗ) и возникновению обязанности покинуть территорию РФ немедленно.

Хочу узнать, в случае того, если военкомат начнет призывать меня, а я буду в РФ, не депортируют ли меня?

теоретически это не исключено. Только речь будет идти не о депортации, а о выдаче. И Интерпол тут может вовсе не понадобиться.

Если Вас в АР объявят в розыск за уклонение от службы в армии по призыву в рамках возбужденного уголовного дела, АР может запросить у РФ помощь и выдачу по уголовному делу на основании "Договора между Российской Федерацией и Азербайджанской Республикой о правовой помощи и правовых отношениях по гражданским, семейным и уголовным делам" (подписан в г. Москве 22.12.1992), но о реальных таких кейсах я уже давненько не слышала, да и раньше это, мне кажется, чаще всего были просто «страшилки».

Однако, с учетом геополитической обстановки в мире прогнозировать что-то — неблагодарное дело.