Подскажите пожалуйста, имею ли я право заключить договор о помощи с двумя благотворительными фондами?

Под благотворительной деятельностью понимается добровольная деятельность граждан и юридических лиц по бескорыстной (безвозмездной или на льготных условиях) передаче гражданам или юридическим лицам имущества, в том числе денежных средств, бескорыстному выполнению работ, предоставлению услуг, оказанию иной поддержки. 

Прямого запрета на оказание вам помощи двумя или более благотворительными фондами я не нашёл, да и звучит этот «запрет» несколько абсурдно. В законодательстве оговорено что целевую благотворительную помощь медицинским организациям может один благотворительный фонд относительно целевого предмета помощи, это оговорено с целью противодействия коррупции и возможно это имел в виду ваш врач. 

Заключайте и второй и третий договор, в любом аспекте вы ничего не нарушаете. Всего хорошего вам.