Скажите как списание будет происходить?

По правилу, ст. 34 Положения о порядке прохождения военной службы 

15. Исключение из списков личного состава воинской части военнослужащего, признанного военно-врачебной комиссиейнегодным к военной службе и нуждающимся в освобождении от исполнения служебных обязанностей и уволенного с военной службы, производится не позднее чем через месяц со дня получения воинской частью заключения военно-врачебной комиссии, не считая времени нахождения военнослужащего в отпуске (отпусках).

Таким образом, при получении заключения ВВК о категории годности Д, командование должно осуществить его увольнение с военной службы.

Общий порядок определен Приказом Министра обороны РФ от 30.10.2015 N 660 «О мерах по реализации правовых актов по вопросам организации прохождения военной службы по контракту в Вооруженных Силах Российской Федерации»

В силу которого

29. На военнослужащего, подлежащего увольнению с военной службы, подготавливается представление, оформляемое согласно приложению N 2 к настоящему Порядку.
К представлению прилагаются:
копия листа беседы;
копия заключения ВВК (в случае увольнения военнослужащего по состоянию здоровья);
другие документы (материалы), подтверждающие основания к увольнению.
Представление и прилагаемые к нему документы направляются в порядке подчиненности в кадровый орган, подчиненный должностному лицу Вооруженных Сил, имеющему право увольнения военнослужащего с военной службы, с расчетом получения их кадровым органом за два месяца до истечения у военнослужащего срока военной службы.

В этой связи издается приказ о его увольнении с возложением обязанностей на соответствующие подразделения по обеспечению его денежным довольствием, рассчитанного по дату исключения из списков части и иными видами обеспечения согласно действующему законодательству.

В течении месяца в отношении него издается приказ о его исключении из списков части.