Написать заявление о выходе и заявление о передаче пая кооперативу и потом подать заявление в налоговую?

Если речь о производственном кооперативе, то согласно ст. 106.5 Гражданского кодекса РФ:

1. Член производственного кооператива по своему усмотрению вправе выйти из кооператива. В этом случае ему должна быть выплачена стоимость пая или должно быть выдано имущество, стоимость которого соответствует стоимости его пая, а также должны быть произведены другие выплаты, предусмотренные уставом кооператива.

Выплата стоимости пая или выдача другого имущества выходящему члену кооператива производится по окончании финансового года и утверждении бухгалтерской (финансовой) отчетности кооператива, если иное не предусмотрено уставом кооператива...

Это практически повторяется в уставе Вашего кооператива.

Чтобы выйти из кооператива члену кооператива достаточно подать письменное заявление на имя Председателя.

По уставу Вашего кооператива заявление должно быть подано как минимум за 2 недели до выхода из кооператива.

Написать заявление о выходе и заявление о передаче пая кооперативу и потом подать заявление в налоговую?

 Пай либо передается кому-то из других членов кооператива, либо кооператив выплатит выходящему члену кооператива стоимость его пая, но только по окончании финансового года и утверждении бухгалтерской (финансовой) отчетности кооператива.

Нужно ли потом обязательно выплачивать стоимость пая по окончанию финансового года, если грубо говоря он будет подарен кооперативу?

 Если пай выходящим членом кооператива будет передан кому-то из других членов кооператива, то, соответственно, выплачивать ему стоимость пая не требуется.