Он на долю квартиры не претендует, но как я могу себя обезопасить в будущем?

Добрый день!

После развода Вы не будете обязаны выделять супругу долю в данной квартире, если она на момент развода не выделена. 

Имущество, купленное на средства материнского капитала, не является совместно нажитым имуществом супругов и после развода не подлежит разделу.
Согласно ст.ст. 38,39 Семейного кодекса в случае развода разделу между супругами подлежит только общее имущество, нажитое ими в браке.