Можно ли их избежать, если нет, то кто и сколько должен заплатить

Мария, добрый день.

По общему правилу минимальный срок владения составляет 5 лет, после которого налогоплательщик освобождается от уплаты налога. Учитывая, то, что Вами квартира приобреталась в 2015 году, то минимальный срок владения составлял 3 года.- ст. 217.1 НК РФ.

Однако, минимальный предельный срок владения объектом недвижимого имущества исчисляется с даты государственной регистрации на него права собственности (п. 2 ст. 8.1 ГК РФ);

Вопросов по Вашей с мужем долям нет, так как срок владения в этом случае исчисляется от даты регистрации права собственности за Вами (за одним из супругов), то есть декабрь 2015 г., и срок владения составил более 3 лет.

Вопрос я так понимаю с долями детей, которые были выделены pарегистрированы в 2023 и в этом же году были проданы, то есть срок владения составил менее минимального срока.

Формально ФНС правы, они не разбираются в деталях, они лишь получили информацию от Росреестра, что возникло право собственности и было продано с несоблюдением минимального срока владения.

Здесь возможно применение налогового вычета пп. 1 п. 2 ст. 220 НК РФ в размере 1 000 000, если сделка была совместной, то на всех, но учитывая стоимость сделки существенной разницы его использование не даст. 

Так же Вы действительно можете избежать уплаты налога по следующему основанию:

Согласно абз. 20-22 пп. 2 п. 2 ст. 220 НК РФ:

2. Имущественный налоговый вычет, предусмотренный подпунктом 1 пункта 1 настоящей статьи, предоставляется с учетом следующих особенностей:

2) вместо получения имущественного налогового вычета в соответствии с подпунктом 1 настоящего пункта налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением этого имущества.

налогоплательщик вправе уменьшить сумму своего облагаемого налогом дохода на величину фактически произведенных и документально подтвержденных расходов на приобретение этого объекта недвижимого имущества в размере, пропорциональном указанной доле налогоплательщика в объекте недвижимого имущества, при одновременном соблюдении следующих условий:

расходы на приобретение объекта недвижимого имущества произведены членом семьи налогоплательщика — владельцем сертификата (иного документа) на материнский (семейный) капитал (членом семьи налогоплательщика — получателем средств бюджетов бюджетной системы Российской Федерации) и (или) его супругом (супругой);

.......

С полным текстом можете ознакомиться здесь:

https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_28165/62f621e5835790398a88f80270fe2cf0b3710b3c/

То есть Вы можете уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением этого имущества в том числе пропорционально на доли выделенные детям.

В Вашем случае это сумма покупки жилья а так же проценты по ипотеке.

При этом покупка нового жилья здесь значения не имеет так как для применения п. 2.1 ст. 217.1 НК РФ, не выполняется одно из условий.

Таким образом здесь оптимальным решением будет применение абз. 20-22 пп. 2 п. 2 ст. 220 НК РФ, то есть подтверждение расходов на покупку данного жилья.

При возникновении вопросов обращайтесь.