И останется ли за мной квартира, которая ещё невыплачена военная ипотека?

Да двое до 16, один 17

 В таком случае Вы вправе досрочно уволиться с военной службы, не дожидаясь истечения срока контракта и достижения предельного возраста.

Право на увольнение у Вас основано на ст. 17 ФЗ от 26.02.1997 N 31-ФЗ «О мобилизационной подготовке и мобилизации в Российской Федерации»

в силу которой

Военнослужащие женского пола, которые имеют одного ребенка и более в возрасте до 16 лет или срок беременности которых составляет не менее 22 недель, имеют право на досрочное увольнение с военной службы.

Таким образом, наличие у Вас одного ребенка в возрасте до 16 лет является достаточным основанием для досрочного увольнения с военной службы. 

При наличии у Вас 20 лет выслуги у Вас возникает право на получение пенсии.

И останется ли за мной квартира, которая ещё невыплачена военная ипотека ?!

Да.

При этом обязанность возвращать полученный по ней целевой жилищный заем у Вас не возникает.

В силу ст. 10 ФЗ «О накопительно-ипотечной системе жилищного обеспечения военнослужащих»

1. Основанием возникновения права на использование накоплений, учтенных на именном накопительном счете участника, в соответствии с настоящим Федеральным законом является:
1) общая продолжительность военной службы, в том числе в льготном исчислении, двадцать лет и более;

В ст. 15 данного закона соответственно указано. что погашение целевого жилищного займа осуществляется уполномоченным федеральным органом при возникновении у получившего целевой жилищный заем участника накопительно-ипотечной системы оснований, указанных в статье 10 настоящего Федерального закона