Через два дня истекает срок подачи кассации, а дело находится в городском суде на исправлении ошибок в определении, примет ли мировой суд кассационное заявление

Дело в городском суде, а кассацию нужно подавать в мировой. Насколько мне известно, после подачи кассации через 3 дня они отправляют дело в кассацию, а дела там нет

Подайте жалобу в суд первой инстанции, не смотря ни на что. Вам необходимо соблюсти сроки на подачу жалобы. Что будет происходить после подачи, уже относится к компетенции суда.

И отсутствие дела в суде первой инстанции ни как не влияет на Вашу обязанность по соблюдению сроков подачи жалобы и ни как не препятствует Вам в этом.