У меня и моей жены в фамилии стоит буква, е,,а у сына в свидетельстве о рождении буква, ё, и мы как родители записаны с буквой, ё, Что делать и на что это может повлиять?

Здравствуйте, Олег! Поменять документы, а в случае отказа установить юридический факт в суде.  Вы вправе обратиться в районный суд для установления юридического факта в порядке, предусмотренном ст.264 ГПК РФ, главами 27-28 ГПК РФ. Однако госпошлина с недавних пор по такому заявлению составляет 30000 рублей согласно пп.10 п.1 ст.333.19 НК РФ. Другой вариант: потребовать исправить ошибку, а отказ обжаловать. Вы вправе обжаловать незаконные действия либо бездействие должностного лица вышестоящему должностному лицу либо в районный суд в порядке, предусмотренном статьями 218-219 Кодекса административного судопроизводства РФ (госпошлина 3000 рублей), а также подать жалобу в прокуратуру.