Добрый день, сын поступил в МЭИ не 1й курс, не закрыл три дисциплины по первой сессии

У него был академ по состоянию здоровья на год. При переводе, не слетит ли отсрочка от армии.

 Если ему ранее отсрочка была предоставлена, то при переводе в другой вуз на 1 семестр 1 курса обучения — то он право на отсрочку утратит.

В таком случае он подлежит призыву на общих основаниях.

Условия сохранения отсрочки при переводе и/или получении академического отпуска является увеличение общей продолжительности обучения не более чем на 1 год.

На это указано в ст. 24 ФЗ «О воинской обязанности и военной службе»

Право на предусмотренную настоящим подпунктом отсрочку от призыва на военную службу сохраняется за гражданином:
получившим во время освоения образовательной программыакадемический отпуск или переведенным в другую образовательную организацию 
Право на отсрочку от призыва на военную службу сохраняется за гражданином по основаниям, предусмотренным настоящим абзацем, только при условии, если общий срок, на который гражданину была предоставлена отсрочка от призыва на военную службу для обучения в данной образовательной организации или в образовательной организации, из которой осуществлен перевод, не увеличивается или увеличивается не более чем на один год;

Таким образом, получив академический отпуск и пробыв в нем сын у Вас увеличил срок обучения на 1 год.

После этого при последующем его переводе в другой вуз на 1 семестр 1 курса — еще увеличивает срок обучения.

Таким образом совокупное увеличение продолжительности обучения у него составит более 1 года.

При таких условиях он утрачивает право на получение отсрочки от призыва.