Выпустят ли за границу если у тебя была повестка и ты в процессе прохождения медицинской комиссии

Я бы не исключал любое развитие событий, учитывая правила статьи 7.1 ФЗ «О воинской обязанности и военной службе» №53-ФЗ от 28.03.98:

1. Гражданам, подлежащим призыву на военную службу, со дня размещения в отношении их повестки военного комиссариата в общедоступном реестре направленных (врученных) повесток (далее — Реестр повесток) в качестве временной меры, направленной на обеспечение их явки по повестке, запрещается выезд из Российской Федерации.

И хотя реестр повесток в полном объёме не работает, всё может быть.

Если Вам необходима дополнительная консультация либо помощь в составлении письменных документов, можете обратиться в мой чат, по правилам сайта услуги в чате платные.
Всего доброго!