В каком размере будут начислены пени?

Здравствуйте, Оксана!

Пени будут начислены на каждый чек? 

Нет, пени начисляются не на каждый чек отдельно, а на общую сумму неуплаченного налога, которая должна была быть перечислена в бюджет из-за несвоевременной передачи чеков.

В каком размере будут начислены пени?

Пени рассчитываются по формуле:

П = Сумма налога × (21% / 300) × количество дней просрочки, 

где:

21% — ключевая ставка ЦБ РФ;
дни просрочки — с 10-го числа месяца, следующего за отчётным, до даты внесения чеков/уплаты налога.

Пример:

Налог к уплате: 10 000 ₽
Просрочка: 5 дней
П = 10 000 × 0,0007 × 5 = 35 руб.